5 automatizovaný karyotypovací software pro mapování chromozomů

Doporučujeme: Program pro opravu chyb, optimalizovat a zrychlit Windows.

Karyotypizace je proces uspořádání a párování všech chromozomů v organismu za účelem získání všeobjímajícího pohledu na celou mapu 'chromozomů' jednotlivce.

Nejdříve se ale ujistěte, že chápeme, co jsou chromozomy na prvním místě. Chromozomy jsou struktury, které vypadají podobně jako vlákna, která jsou obsažena v jádru každé buňky vašeho těla.

Každá struktura chromozomu obsahuje celý genetický informační plán vašeho těla. To určuje způsob, jakým je vaše tělo strukturováno, reaguje na podněty, náchylnost k nemocem atd. Ženy mají 2 'X' chromosomy a muži mají jeden 'X' a jeden 'Y' chromozóm. Každá buňka těla obsahuje 23 párů chromozomů, celkem 46 chromozomů.

Aby vědci byli schopni porozumět sekvencím chromozomů každého pacienta, používají karyotypovací software . Tento typ softwaru je určen k provádění analýzy chromozomů a vyhodnocuje strukturu a počet chromozomů člověka. Tímto způsobem mohou vědci a vědci detekovat abnormality.

V tomto článku budeme zkoumat některé skvělé softwarové možnosti, které vám umožní provádět karyotypovací analýzu.

Top 5 automatizovaných nástrojů karyotypingu, které budou použity v roce 2019

1

ArgusSoft

ArgusSoft je skvělá softwarová volba, která vám umožní automaticky karyotypovat lidské chromozomy podle pozice pásma a může být také použita pro karyotypování zvířat a chromozomů rostlin online.

Klíčové vlastnosti:

  • Barvení G, Q, R
  • Automatizované karyotypování lidských chromozomů s rozpoznáním ohybů
  • Automatizované karyotypování chromozomů prasat
  • 3 vestavěné základy standardních ideogramů lidských chromosomů s různými úrovněmi jasnosti - 400, 550 a 850 úrovní
  • Může přidávat báze standardních cromozomových ideogramů pro ostatní živočišné a rostlinné druhy
  • Metody přípravy vzorků
  • Zadávání obrazů metafázových desek pomocí kamery a skeneru
  • Doprovodný obrázek s grafikou
  • Automatizované dělení aplikovaných a kontaktních chromozomů
  • Srovnání chromozomů a ideogramů

Můžete také použít ArgusSoft k trénování systému rozpoznávání chromozomů pomocí přednastavených přípravků, můžete přenášet obrazy metafázových desek a karyogramy do vestavěné databáze, vytvářet vzory reportů, opravovat karyogramy a ukládat a tisknout obrázky a výsledky analýz.

Můžete získat školení a podporu pro používání ArgusSoft z jejich oficiálních internetových stránkách. Středisko podpory zahrnuje školení, údržbu a poradenské služby.

Vyzkoušejte ArgusSoft

2

HiBand aplikovaným spektrálním zobrazováním

HiBand je software vytvořený aplikací Applied Spectral Imaging, který může provádět pokročilé analýzy chromozomů pomocí digitálních funkcí karyotypování. Tento software

používá automatizované skenovací funkce pro hloubkovou analýzu struktury chromozomu.

Pro indexování, počítání, ukládání a správu dat o výsledcích můžete použít širokou škálu funkcí, které jsou v systému HiBand k dispozici. Tento výkonný software můžete také použít k automatickému skenování sekvence chromozomů.

Výsledky získané pomocí nalezených karyotypových funkcí HiBand mohou být uloženy na bezpečném místě s chráněnými hesly a šifrovanými vrstvami. To vám umožní klid, pokud jde o ztrátu důležitých sekvenčních dat, a díky tomu také zlepšuje efektivitu vaší laboratoře.

Třídění podle výsledků se provádí velmi snadným způsobem, stačí vyhledat konkrétní posloupnost chromozomů a všechny výsledky se zobrazí v dobře obsažené obrazovce, která nabízí snadný přístup k úpravám, recenzím a také k přidávání značek do všech souborů.

Klíčové vlastnosti:

  • Brightfield Karyotyping-G-Band a R-Band
  • Fluorescenční Karyotyping-Q-Band, R-Band a FISH
  • Spektrální karyotypování
  • Automatické počítání chromozomů
  • Indexování a klasifikace chromozomů
  • Pokročilá separace chromozomů a pokročilé vylepšení obrazu
  • Galerie obrázků - umí prezentovat všechny případové metafáze a karyotypy na jedné obrazovce
  • Porovnat chromozomy - viz vedle sebe
  • Abberant Ideogram - můžete přidat generátory chromozomů, buněk, ideogramů a anotací

HiBand využívá plně automatizované pracovní postupy pro zvýšení účinnosti laboratoře, má funkce „start-and-walk-away“, vyhledává metafáze, automaticky čte čárové kódy, nahrává obrázky v reálném čase během skenování snímků a také exportuje do laboratoře LIS Central Portal a Databáze.

Vyzkoušejte HiBand

3

Ikaros by MetaSystems

Tento karyotypovací systém má velmi intuitivní uživatelské rozhraní, které nabízí všechny funkce na jedné obrazovce. To umožňuje snadný a rychlý přístup ke všem získaným informacím.

Ikaros lze použít s Neonem, což je platforma, která má pomoci s obrazovými daty a případovou organizací. Neon shromažďuje data ze všech zobrazovacích úloh, externích zdrojů a umožňuje vám je prezentovat snadno srozumitelným způsobem pomocí řídicího panelu pro správu případů.

Tento nástroj vám umožňuje mít vždy po ruce důležité informace a bezpečně je ukládat, ale používá velmi silné algoritmy pro správu dat, má řadu možností, jak pozorovat data a poskytovat konkrétní vyhledávání na základě klíčových slov a datových charakteristik.

Více informací o Neonu a jeho vlastnostech naleznete zde .

Ikaros podporuje mnoho různých technik lepení - Brightfield G-Band a R-Band, Fluorescenční Q-Band, R-Band a FISH - nabízí velký počet pre-definuje karyogram forem pro lidi, rostliny a zvířata. Tyto formuláře můžete snadno upravovat a přidávat data potřebná pro daný typ výzkumu.

Skutečnost, že můžete porovnávat chromozomy podle třídy nebo karyogramů, vám nabízí velmi užitečné informace, které vám umožní snadno identifikovat rozdíly.

Vyzkoušejte Ikaros

4

MetaClass by Microptic

MetaClass je skvělý karyotyoping software, který je navržen modulárním způsobem. Tento software vám pomůže provádět karyotypování a FISH studie chromozomů.

MetaClass je tvořen z následujících modulů:

  • Databáze MetaClass

Databáze, která může být instalována s některým z modulů MetaClass. Umožňuje ukládat podrobnosti o pacientovi a umožňuje snadný přístup k výsledkům. Pomocí tohoto modulu můžete vytvářet přizpůsobené sestavy v libovolném jazyce.

  • MetaClass Karyotyping

Umožňuje studovat karyotyp poté, co byly snímky fáze přípravy metafáze digitálně zachyceny, a uspořádat je do dvojic podle velikosti, pozice atd. Tento modul vám poskytuje vynikající výsledky kvality, pokud jde o pásy chromozomů, a může také vám poskytnou profesionálně vypadající zprávy.

Mezi klíčové funkce patří:

  • Studie karyotypu se analyzuje za jasného 100násobného zvětšení
  • Dokáže zachytit několik obrazů Metafáze
  • Kvalita obrazu je upravitelná pro ostřejší výsledky
  • Automatická klasifikace chromozomů
  • 4 zobrazení obrazovky - Metafáze, Karyotyp a Nezařazené chromozomové okno
  • Může zobrazit prototypy chromozomů
  • Chromozomy, které nejsou klasifikovány, mohou být automaticky nebo ručně korigovány - superpozice, separace, křížení, rotace atd.
  • Soubory relací MTC nebo obrázky BMP lze kdykoli uložit a znovu načíst
  • Lze exportovat jednotlivé chromozomy do databáze Metaclass s možností přidávat komentáře a poznámky

Zde je příklad zprávy o karyotypování Metaclass.

  • MetaClass FISH

Jedná se o analytický modul, který umožňuje získat obraz fluorescenční IN SITU hybridizace (FISH). Tento modul zachycuje snímky pomocí fluorescenčních DNA sond a umožňuje potvrdit genetické abnormality - trisomie, mocrodelections, chromozomové přeskupení atd.

Snímky FISH jsou analyzovány při 100násobném zvětšení a pro širší rozsah čistoty obrazu mohou také pořizovat snímky s různými filtry.

Máte-li zájem dozvědět se více informací o výše uvedených modulech a dalších funkcích, můžete si prohlédnout katalog MetaClass.

Pokud jste zvědavý typ a chcete vidět zprávu získanou pomocí metody FISH, můžete

vzorový soubor PDF.

Vyzkoušejte MetaClass

5

Genasis Bandview

GenASis Bandview je další skvělý karyotypovací software, který je vytvořen z modulů s různými capabitilites. Pomocí této aplikace můžete provádět diagnostiku karyotypů a získat přesné výsledky testů.

Tento software vám umožní plně přizpůsobit pracovní postup a diagnostický proces v závislosti na potřebách vaší společnosti a cílech, kterých se snažíte dosáhnout.

Široká škála nástrojů poskytnutých v aplikaci BandView je snadno dostupná jediným kliknutím myši a nabízí výkonné zkušenosti s karyotypem G / R / C / Q-Band. Můžete si vybrat mezi automatizovaným nebo manuálním pracovním tokem, pokud jde o lokalizaci metafáz a pořizování snímků.

Abnormality chromozomů, pokud jsou nalezeny, mohou být pozorovány přidáním, delecí nebo přeskupením genetického materiálu pacienta. S BandView můžete použít pásmo molekulární techniky FISH.

FISH používá flourescentní sondy pro připojení k různým částem chromozomu, což umožňuje softwaru detekovat a lokalizovat abnormity nalezené ve specifických sekvencích DNA.

Vyzkoušejte GenASis Bandview

Závěr

V tomto článku jsme prozkoumali některé z nejlepších automatizovaných karyotypovacích programů, které existují na trhu na konci roku 2018.

Možnosti softwaru karyotypingu uvedené v tomto článku nabízejí řadu funkcí, které vám pomohou dosáhnout cílů vaší společnosti.

Použitím tohoto typu softwaru můžete rychle počítat tisíce struktur chromozomů, analyzovat s různými profesionálními technikami a vytvářet vysoce kvalitní zprávy, které vám umožní snadno identifikovat jakékoli abnormality.

Rádi bychom zjistili, jaký je váš názor na software, který jsme uvedli v tomto top 5 seznamu. Prosím, neváhejte a dejte nám vědět pomocí komentáře níže.

SOUVISEJÍCÍ POKYNY, KTERÉ POTŘEBUJETE KONTROLA:

  • Potřebujete průzkum software pro akademický výzkum? Zde je 5 nástrojů
  • 5 nejlepších software pro akademické psaní
  • 10 nejlepších plagiátorství software pro detekci obsahu kopie v roce 2019

Doporučená

Chyba VILIFIERU DMA VERIFIER v systému Windows 10 [FIXED]
2019
7 nejlepších nástrojů pro úpravu obrazu pro uživatele Windows
2019
4 fotbalový software pro střih videa pro zvýraznění všech detailů vašich zápasů
2019